佩德罗二世签署退位诏书的消息扩散到皇宫之外，加西亚上将、埃贝尔中校、洛雷托男爵等部分保皇党军官察觉到，里约热内卢城内的局势已经无法逆转，因此，以加西亚上将为首，几支分散的保皇党军队趁着城内混乱的时机，迅速聚集在一起，护送着巴西帝国皇储伊莎贝拉公主和她的丈夫伊尤伯爵离开里约热内卢，然后登上五艘保皇党控制的军舰，启程前往巴西北部地区。…………
军事政变发生后的第四天上午，共和派、民主派两方联合宣布建立共和政府，推举丰塞卡为新政府临时总统，共和派领袖莫拉伊斯为议会议长，佩绍托等参与政变的将领和政府官员则分别瓜分剩下的政府要职。
共和建立，莫拉伊斯第一时间拜访英国驻巴西公使，承诺遵守巴西帝国时期与英国达成的一切政治经济合作，共和政府的表态赢得了英国政府的认同与赞赏，作为回应，英国驻巴西公使奥斯顿宣布，英国政府尊重巴西人民的意愿，承认新政府的合法性，并且愿意与巴西政府就两国的交流与合作，展开更加深入的沟通。
南美第一领土大国在几天完成了政权的替换，随着帝国首都政变成功的消息扩散到巴西全境，圣保罗州、巴拉那州、戈亚斯州等重要地区顺利落入共和政府手中。
巴西海军主要军舰停靠在圣保罗和里约热内卢两地，加西亚上将逃离里约热内卢的时候，利用海军士兵们对伊莎贝拉公主的效忠，拉拢了两艘铁甲舰在内的五艘大型军舰护送他们离开。
巴西海军总共拥有五艘铁甲舰，两艘排水量总吨位达到7800吨的主力战舰脱离编制，使得新成立的共和海军战斗力瞬间缩水一半。
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海军是高技术兵种，巴西海军的中高层军官百分之八十以上出身上层阶级，因为佩德罗二世不合时宜的改革，大部分地主、贵族放弃了对他的支持，不过面对帝制统治的终结和政治权力遭受严重削弱的后果，约四成的海军官兵选择效忠帝国皇储，期望跟随伊莎贝拉公主打回里约热内卢，夺回中央政府控制权。
巴西共和政府掌控海军军舰的行动不像掌控陆军那般顺利，1879年8月21日，300余名海军官兵擅自离开军港，驾驶两艘中型护卫舰向北部海域驶去，8月23日，七名中层军官策划煽动海军士兵控制剩余的三艘铁甲舰投奔伊莎贝拉，结果被警觉的军港守备司令发现，及时制止了他们的行动。
海军人心浮动，主力军舰吨位流失近一半，中下层军官流失约七成，大踏步接收中部、南部各地区军事控制权的共和派政府陡然间，遭遇到一个严重的挫折。
海军实力的流失与削弱，一方面导致共和政府对海军不信任态度的加剧，大量出身贵族家庭的海军军官被勒令禁止登上军舰，剩余的三艘铁甲舰和十余艘军舰被集中到里约热内卢军港内，由丰塞卡派出的陆军部队严格把守港口炮台和出入口，预防海军投奔北方的事变再次发生。
另一方面，伊莎贝拉公主一行两千余人抵达
巴伊亚州首府萨尔瓦多，凭借伊莎贝拉帝国皇储的身份和加西亚上将、福罗伯特公爵、埃贝尔中校等保皇党将领在军队中的影响力，驻守萨尔瓦多的一万五千余中央军宣誓效忠伊莎贝拉公主，此后，加西亚上将和福罗伯特公爵将跟随伊莎贝拉公主从里约热内卢逃脱出来的军官分派到一万五千名士兵中，对萨尔瓦多的军队进行重新改编。
8月22日，军队修整补充两日，滞留萨尔瓦多城内的保皇党军队快速扩增到两万五千人，当天中午，在福罗伯特公爵主持下，伊莎贝拉公主自行加冕巴西帝国女皇，对外宣称共和政府为叛逆，号召巴西各地军队效忠帝国，消灭共和政府。